A、由于等位基因位于同源染色体上，因此形成配子时，等位基因随同源染色体分离而分开，A正确；B、D和d是位于同源染色体的同一位置上，控制相对性状的基因，是等位基因，B正确；C、D和D虽然位于同源染色体的同一位置上，但不是控制相对性状，不是等位基因，C错误；D、等位基因控制相对性状，D正确．故选：C．
