A、若以A、a这一对等位基因为例，在一个种群中，可有6种不同的交配类型，即AA×AA、AA×Aa、AA×aa、Aa×Aa、Aa×aa、aa×aa，A正确；
B、最能说明基因分离定律实质的是F1减数分裂过程中等位基因分离，产生两种比例相等的配子，B错误；
C、鉴别一棵植物是否为纯合子，可用测交法和自交法，其中自交法最简便，C正确；
D、由于测交是与隐性个体杂交，而隐性个体只能产生1种含隐性基因的配子，所以通过测交后代表现型种类和比例可以推测被测个体产生配子的种类和比例，D正确．
故选：B．
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