派出所依法对你进行询问，这点没有错。如果他们怀疑你的话，还会用打电话通知的文明形式让你来派出所？我相信他们也只是进行排查而已。对于你留下指纹这点派出所做法也是符合规定的。根据我国《刑事诉讼法》以及《公安机关办理刑事案件程序规定》的规定，公安机关可以依法对证人进行询问，依法对嫌疑人进行讯问。在案件排查过程中，公安机关可以依法对证人或犯罪嫌疑人进行取证（DNA或指纹等）。
顺便说一下，以后居民指纹录入公安系统是一个趋势，现在某些地方已经开始实施。因此留下你的指纹也并不就是说你是犯罪嫌疑人，相信他们只是进行大范围的排查工作，排除你的嫌疑，对你是有利的。
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